秘密航線劇情介紹:
吳隊長收到報告，說有一艘船要延誤登陸，但是一直沒見到船，張連長帶領游擊隊排查福州碼頭和南平碼頭，希望能在炸彈引爆之前阻止災難發(fā)生。
有一批日本留下的毒氣彈，至今下落不明，如果毒氣彈爆炸，整條閩江以及閩江沿岸的空氣、水源都會受到污染，百姓和部隊都會受到影響，所以必須找到紫石英號，這條幽靈一般的船將是他們唯一的線索。
真正的紫石英號已經(jīng)沉船了，所以很可能是一條外形相似的船進行改裝，掛上紫石英號的名頭繼續(xù)前行，吳隊長想起下午簽發(fā)了一張改裝游輪的通行證，這應該就是紫石英號。
福州碼頭交給張連長，謝一航駕駛前進號去追紫石英號船，謝金虎堅持要跟著謝一航同行。
紫石英號上，夏天海和一批特務預謀著，一到子時就將紫石英號撞上南平碼頭，南平碼頭有毒氣庫，船爆炸之后會立刻燃爆毒氣庫，之后夏天海乘坐救生船離開，原來這紫石英號船，本身就是一個高威力炸彈，用船做炸彈的想法，實在出乎所有人意料。
張連長搜查了整個碼頭，剩下唯一一個倉庫，里面有許多保密局特務看守，吳隊長以水警局隊長的身份，進去跟特務套近乎，故意打翻了一箱貨，里面果然全是高威力炸彈。特務正準備向吳隊長開槍，張連長和游擊隊立刻沖進倉庫。
夏天海以前在家的時候，根本不會用左手，謝一航想起有一次看到夏天海左手拿槍，且槍法極準，這說明夏天海受過高強度訓練，擅長使用左手，謝一航回憶馮振山被殺事件，以及夏天海拿還鄉(xiāng)名冊事件，一樁樁事情聯(lián)系到一起時，發(fā)現(xiàn)原來最懷疑的人，就是他曾相信過的大哥。
紫石英號的發(fā)動機突然壞了，特務們緊急搶修，前進號追上了紫石英號，謝一航擔心被對方發(fā)現(xiàn)，和謝金虎一起乘坐救生艇先過去，來喜留守在前進號上。
張連長和保密局特務開戰(zhàn)，吳隊長從未見過這不要命的打法，躲在貨箱后面不敢動，卻發(fā)現(xiàn)角落有一個炸彈是定時的，且時間馬上就到了，而游擊隊的拆彈員被殺，現(xiàn)在只有吳隊長一個閑人，張連長一邊打敵人，一邊教吳隊長拆彈，吳隊長緊張的滿頭是汗，最終在最后一秒的時候，剪下了關鍵的那根線，子彈沒有爆炸。
謝一航潛入紫石英號的輪機房，試圖讓紫石英號停下，而謝金虎留在外面對付那些特務們。
謝一航在貨倉發(fā)現(xiàn)了大量炸彈，這時夏天海帶著特務出現(xiàn)擊殺謝一航，謝一航殺了倉庫的特務，卻不是夏天海的對手，謝一航終于看清了自己這個大哥的真面目，原來夏天海將還鄉(xiāng)名冊交給謝一航，是想用還鄉(xiāng)名冊做墊腳石，便于他自己繼續(xù)潛伏，他才是那個神秘的保密局幕后黑手。
毛森司令給夏天海下的命令，是一直潛伏在福建，秘密建立反共基地，可以在此潛伏幾十年，為了利用謝一航的兄弟身份，夏天海早就知道謝一航共黨的身份，卻一直沒有揭穿他，反而暗中幫助謝一航，因為只有謝一航才能掩護夏天海完成任務。
謝一航被打成重傷，幾近死去，夏天海故意留著謝一航的性命，他相信謝金虎一定會來，夏天海將謝一航銬在倉庫的欄桿上。
上次在倉庫夏天海對
馮雅琴起了殺心，但最終沒有下去手，一個保密局的特務準備殺馮雅琴，夏天海開槍殺了特務，也傷了馮雅琴，之后馮雅琴一直處于昏迷之中。夏天海上紫石英號時，將馮雅琴也帶上船。
謝金虎沖到船艙，跟夏天海發(fā)生正面沖突，夏天海的槍中恰巧沒了子彈，謝金虎狠不下心殺他，將他打昏之后，進去尋找謝一航。
謝一航硬生生將自己的手從手銬中拽出來，之后拖著傷軀前去輪機房，輪機房的船舵卡住了，無法正常轉(zhuǎn)舵，這時謝金虎來到輪機房協(xié)助謝一航。
謝一航用混合的機油倒進發(fā)動機，不一會兒發(fā)動機就會爆炸，船到不了南平碼頭就會爆炸，南平碼頭的毒氣庫不會受到影響。
馮雅琴從房間出來后，被醒來的夏天海挾持來到輪機房，謝金虎開槍殺了挾持馮雅琴的特務，并跟夏天海動起手，馮雅琴撿起特務的槍，沖著夏天海開槍。
謝一航讓謝金虎帶著馮雅琴跳水逃生，他自知傷勢太重，活不了，最后一個愿望是希望馮雅琴活著，在謝一航的請求下，謝金虎拽著馮雅琴離開了輪機房。
輪機房里只剩下謝一航和夏天海兩個等死的人，夏天海感嘆自己能死在最愛的女人手里，此生無憾了。夏天海告訴謝一航，自己提前改變了航線，船和南平碼頭的距離縮短了一半，所以在紫石英號爆炸前，船就會撞上南平碼頭。
謝一航爬到船舵前，拼命想要改變航線，但他力氣用盡，根本轉(zhuǎn)不動船舵，這時馮雅琴又回到輪機房，并幫助謝一航轉(zhuǎn)動船舵，謝一航想讓馮雅琴立刻離開，馮雅琴卻甘愿留下，因為沒有謝一航的日子，她無法獨活。
紫石英號的航線成功改了，馮雅琴抱著謝一航在船上等待著船的爆炸，回想這一路走來，為了福建的解放，死了太多人，謝一航也辜負了馮雅琴太多，此刻能相擁而死，也是另一種幸福。
